Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P18530 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
P18530 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18530 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18530 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
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