Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
P18529 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P18529 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18529 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18529 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18529 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18529 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P18529 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18529 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18529 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18529 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18529 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18529 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18529 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18529 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P18529 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms