Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pou4f1P17208 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms