Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms