Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P10404 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P10404 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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