Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb3P09026 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb3P09026 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms