Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06344 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06344 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06344 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06344 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06344 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06344 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06344 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06344 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06344 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06344 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06344 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06344 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P06344 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06344 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06344 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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