Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lnx1O70263 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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