Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms