Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17078M0QW51 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms