Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm2056J3QQ02 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms