Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20828J3KMI7 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms