Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21977F6U3N7 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms