Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Myo5cE9Q1F5 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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