Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms