Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Brpf1B2RRD7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Brpf1B2RRD7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brpf1B2RRD7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Brpf1B2RRD7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Brpf1B2RRD7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brpf1B2RRD7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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