Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CK137956B1AYM9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms