Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Syndig1A2ANU3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syndig1A2ANU3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms