Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Prdm2A2A7B5 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Prdm2A2A7B5 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Prdm2A2A7B5 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Prdm2A2A7B5 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Prdm2A2A7B5 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm2A2A7B5 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Prdm2A2A7B5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Prdm2A2A7B5 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Prdm2A2A7B5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Prdm2A2A7B5 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm2A2A7B5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms