Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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