Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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