Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Stx12Q9ER00 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms