Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms