Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Zcchc13Q9D548 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Zcchc13Q9D548 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Zcchc13Q9D548 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Zcchc13Q9D548 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Zcchc13Q9D548 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Zcchc13Q9D548 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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