Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc47Q9D024 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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