Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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