Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Cnot11Q9CWN7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Cnot11Q9CWN7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Cnot11Q9CWN7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot11Q9CWN7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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