Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms