Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TpbpbQ9CQC0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms