Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ85

Timm22, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm22Q9CQ85 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Timm22Q9CQ85 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Timm22Q9CQ85 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Timm22Q9CQ85 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Timm22Q9CQ85 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Timm22Q9CQ85 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Timm22Q9CQ85 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Timm22Q9CQ85 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Timm22Q9CQ85 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms