Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nsmce3Q9CPR8 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nsmce3Q9CPR8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nsmce3Q9CPR8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nsmce3Q9CPR8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nsmce3Q9CPR8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms