Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

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Length 1,463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rims1Q99NE5 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms