Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp26Q99MX1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms