Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rcbtb2Q99LJ7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms