Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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