Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim11aQ99J19 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms