Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctu1Q99J10 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctu1Q99J10 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms