Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MyripQ8K3I4 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms