Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.9 ms