Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc38Q8CDN8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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