Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ccdc88cQ6VGS5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc88cQ6VGS5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ccdc88cQ6VGS5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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