Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nop58Q6DFW4 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop58Q6DFW4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms