Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tfe3Q64092 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms