Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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