Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms