Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms