Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rbm27Q5SFM8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rbm27Q5SFM8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rbm27Q5SFM8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rbm27Q5SFM8 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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