Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Trappc1Q5NCF2 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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Trappc1Q5NCF2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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Trappc1Q5NCF2 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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Trappc1Q5NCF2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
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