Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Shcbp1lQ3TTP0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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