Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

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Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Col24a1Q30D77 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Col24a1Q30D77 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Col24a1Q30D77 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Col24a1Q30D77 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Col24a1Q30D77 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Col24a1Q30D77 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Col24a1Q30D77 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Col24a1Q30D77 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Col24a1Q30D77 Dtymk-203ENSMUST00000112893 1040 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Col24a1Q30D77 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col24a1Q30D77 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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